代表性成果简介: 关于植物高温胁迫的大多数研究都集中在差异表达基因的发现上。一些研究已经非编码 RNAs 在植物对非生物胁迫的响应过程中的调控功能。但是,使用第二代测序技术很难准确地探索转录本的全长,从而限制了非编码 RNAs 的挖掘。因此,研究使用二+三代测序技术对40℃热胁迫下的琼岛杨和加杨转录组进行了挖掘,在琼岛杨和加杨中鉴定的差异表达 miRNA、lncRNA 和mRNA 注释均显示与热胁迫密切相关。通过构建互作网络发现琼岛杨中lncRNA 可以顺式调节 HSP18.2;加杨中同样也发现 lncRNA 调控 HSP82 和 HSP83 等基因响应热胁迫。表明 lncRNA 可以调控 HSP 响应杨树的热胁迫。构建的琼岛杨 miRNA-lncRNA-mRNA 网络也显示 miRNA 可调控 lncRNA 和 mRNA 响应热胁迫。综上结果表明非编码 RNA 在杨树的热胁迫中扮演重要角色。相关研究结果目前发表以“林木遗传育种国家重点实验室开放基金项目”为标注的 SCI 论文1篇。 论文链接:https://doi.org/10.1186/s12864-020-06979-z |